很多老师有没有一种感慨，辛辛苦苦做完实验设计，测序工作，数据分析和文章撰写，在文章发表的前夕，还有一项磨人的工作不得不做，那就是数据上传。
为什么要进行数据上传？
数据上传到哪里？
怎么进行数据上传？
突然之间的三连问是不是有点懵，不要怕，本篇软文就来带领大家梳理这些问题，数据上传So easy~
为什么要进行数据上传？
简单来说，为了发表文章，但根本原因是为了帮助大家管理这些动辄几十个G或者几T的数据，同时实现科研共享。
数据上传到哪里？
这里建议将数据上传到NCBI的SRA数据库。NCBI SRA（Sequence Read Archive）数据库是最常用的存放测序Raw Reads的数据库（当然还有GEO等其他大的相关的上传数据的数据库，大家感兴趣的可以自行检索）。
将测序数据上传至该数据库，可分为4大步：
▶ 注册并登录NCBI账号；
▶ 申请BioProject号；
▶ 申请BioSample号；
▶ 创建SRA提交任务。
搞清楚这4大步，上传过程不复杂！
一 注册并登录NCBI账号
网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
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打开网址，点击右上角 Sign in to NCBI；
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点击注册账号 Register for an NCBI account；
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填写账号邮箱等信息，点击 Create accout 完成注册。
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二 申请BioProject号
登录账号后，打开网址https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/，并进入，界面如下。
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点击 BioProject，再点击 New submission。BioProject：主要描述测序项目的研究目的，不同类型的数据（如基因组和转录组）可以都放到一个BioProject下。申请成功后，NCBI会给一个类似PRJNA544896这样的号，申请过程任何遇到问题，可以写信给他们的工作人员（genomeprj@ncbi.nlm.nih.gov），很快就能收到回复；
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SUBMITTER，填写信息，完成后点击continue。
注：Submitting organization：提交组织、机构或者学校等研究单位。Department：实验室或课题组或科室名称。
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SAMPLE TYPE，选择数据类型。转录组数据选择第二个，其它数据视实际情况选择。Sample scope选择Multiisolate。点击continue；
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输入测序数据的物种拉丁名（必填），如果是微生物细菌，还需要填写菌株的名称。分离提取或培养组织名称等，简单描述，此处可省略。点击continue；
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填写project释放时间，如没有特殊要求，一般为立即释放，Public description，主要写数据测序目的，测序组织等。此处必须填写。点击continue；
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填写Biosample。此处省略，直接continue。因为上传步骤一般先申请Bioproject号，再申请Biosample号。点击continue；
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如果文章已经发出，可以填写Pubmed ID或者文章的DOI。点击continue；如果文章还未发出，可以不填。
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确认填写的信息，点击submit后提交完成。
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至此Bioproject号申请完成，会立即收到邮件。
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三 申请BioSample号
打开网址https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/。这与BioProject号不同，这里要求每个样品申请一个biosample号。
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点击BioSample后，在新的界面点击New submission；
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SUBMITTER，填写信息。同BioProject。点击continue；
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GENERAL INFO，同BioProject，多个样品选择Batch/Multiple Bio Samples。点击continue；
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SAMPLE TYPE，选择样品的类型，植物、动物、人等，选择和自己样品分类一致的选项即可。点击continue；
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ATTRIBUTES，上传样品信息表。点击红色箭头处，下载信息模板。点击绿色箭头处，可以查看模板中每一项表头的解释，得知如何填写样品信息表。excel可直接打开下载的模板，如图：表格绿色部分必填，黄色部分选填，蓝色表示这些字段中至少有一个是必需的，如果信息不可用，请根据情况输入“未收集”、“不适用”或“缺少”。。每个样品生成一个文件（先填写一个文件试着上传，如果有报错可以修改，之后只需改动样品名即可）。点击continue；
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确认填写的信息，点击submit后提交完成。几分钟内就会收到邮件，包含BioSample号。
四 创建SRA提交任务
打开网址https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/，并进入。
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点击SRA，New submission。文件可以用gzip或者bzip2压缩，不能用zip压缩。注：所有文件名必须唯一不可重名；
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SUBMITTER，填写信息，同BioProject号申请。点击continue；
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GENERAL，填写申请好的BioProject号及数据释放时间。点击continue；
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METADATA，上传文件信息表。点击箭头处，下载表格模板，并按照介绍填写（每一列都必填），填写完成后在浏览处上传表格，点击continue。
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FILES，上传压缩好的原始数据，如果文件大于10GB，或者多于300个文件，不能用网页上传，可安装Aspera插件后上传。点击箭头处下载插件，安装后回到网页继续上传。由于测序数据较大，网速的限制等原因，这个过程所需时间可能较长，还请大家耐心等待哦。
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OVERVIEW，确认填写的信息，提交。
完成了前面的四个步骤，所有的操作就已经完成了，静静等待NCBI发送序列号邮件就可以了。
欢迎大家学习和尝试前往NCBI上传原始数据，测序文章的成功发表，离不开数据的成功上传，大家加油~~